Подскажите по каким формулам начисляется заработная плата менеджеров-логистов в транспортно-экспедиционных компаниях.

Неужели никто не знает по каким критериям начисляется зарплата? Или это коммерческая тайна?

Процент от принесенной прибыли либо мин ставка + процент. Размер процента - личное дело каждой экспедиции (от 5 до 50 %).
Также на усмотрение директора эксп компании вводится или не вводится сбор с сотрудников за телефонные разговоры либо на офисные затраты.

Действительно, это есть коммерческая тайна.

Многие экспедиции работают процента от сделок, но для менеджера устанавливается минимальный план, который он должен выполнить.

Все правильно:мин.план+оплата,деленная на всех,за телефон.
Тогда никто не ворует,и очень заинтересован в работе(очень повышается КПД)